Бактерия Черной смерти оставалась в Европе более 350 лет после завершения первой пандемии

Международная группа ученых под руководством Тартуского университета восстановила 26 геномов Yersinia pestis — бактерии, вызывающей чуму. Материал для анализа взяли из останков, найденных в 11 археологических локациях в Эстонии, Нидерландах, России, Швейцарии и Англии. Возраст образцов охватывает период с 1349 по 1710 год.

Результаты исследования в журнале PNAS показывают: пандемия 1347–1353 годов стала лишь началом. Одна и та же генетическая линия бактерии провоцировала вспышки болезни в Европе на протяжении последующих 350 лет.

Эта линия (Branch 1) породила штаммы, вызвавшие вторую (1356–1366), третью (1362–1379) и четвертую (1378–1389) волны чумы. Позже та же бактерия убивала людей во время Тридцатилетней войны (1618–1648) и Великой Северной войны (1700–1721). Последним зафиксированным эпизодом, генетически связанным с «Черной смертью», стала Великая чума в Марселе в 1720–1722 годах.

Новый метод датировки

Для привязки геномов к конкретным событиям ученые разработали метод PhIRM (Phylogenetically Informed Radiocarbon Modelling). Он объединяет данные радиоуглеродного анализа с информацией о генеалогическом древе бактерии. Раньше погрешность при датировке образцов этого периода превышала 100 лет, что не позволяло связать останки с определенным историческим броском болезни. PhIRM сократил этот интервал до нескольких десятилетий.

«Во время пандемии COVID-19 ученые отслеживали распространение штаммов в реальном времени благодаря точным датам. У исторических образцов таких меток нет, поэтому нам пришлось создать новый инструмент», — объясняет ведущий автор исследования Марсель Келлер.

Скорость и пути распространения

Исследование выявило генетически идентичные образцы Yersinia pestis в Англии, Дании и России. Это подтверждает эпизоды стремительного перемещения инфекции по континенту. В период «Великой засухи Возрождения» (1450–1500 годы) линия бактерии разделилась на три основные ветви. Исследователи предполагают, что в это время патоген мог закрепиться в местных популяциях диких грызунов, создав постоянные природные очаги.

Данные показывают, что бактерия эволюционировала и распространялась вдоль маршрутов движения войск и беженцев в периоды затяжных военных конфликтов.

Случай сочетанной инфекции

В массовом захоронении 1710 года в Таллине ученые обнаружили редкий случай коинфекции. В останках одного человека одновременно присутствовали ДНК Yersinia pestis и Treponema pallidum (возбудитель сифилиса). Это второй подобный случай, зафиксированный с помощью анализа древней ДНК. Находка дает редкое представление о состоянии здоровья населения во время эпидемий начала XVIII века.